Bioinformatiker

Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi / Laborantjobb / Uppsala
2023-02-17
Observera att sista ansökningsdag har passerat.
➡️ Klicka här för den senare publicerade platsannonsen "Bioinformatiker" (publicerad 2023-12-15) ⬅️


Visa alla laborantjobb i Uppsala, Östhammar, Sigtuna, Österåker, Håbo eller i hela Sverige
Visa alla jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi i Uppsala, Stockholm eller i hela Sverige

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.

a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 500 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: http://www.igp.uu.se

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet: https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Publiceringsdatum
2023-02-17

Dina arbetsuppgifter
Personen kommer arbeta med analys av longread-sekvenseringsdata från PacBio och Oxford Nanopore. Främst gäller det bioinformatiska analyser inklusive alignment, variantanalys, assembly och identifiering av kliniskt relevanta varianter. Nya analysverktyg behöver sättas upp, t ex Deep Variant, för variantanalys. Den anställde kommer också vara med och sätta upp metoden "adaptive sampling" på labbet, men främst med ansvar för datahantering och dataanalys. I projektet kommer patientprover analyseras för att identifiera sjukdomsorsakande variation

Kvalifikationskrav
Sökande ska ha genomgått en grundutbildning i biomedicin, bioteknik, bioinformatik eller motsvarande. Vana att arbeta i unixmiljö är ett krav. Personen skall ha erfarenhet av att arbeta med longread-data från Oxford Nanopore och PacBio inklusive alignment, variant calling, assembly, metyleringsanalys samt visualisering av genetiska data. God förmåga att uttrycka sig såväl muntligt som skriftligt på engelska. God samarbets- och kommunikationsförmåga. Då utvecklingen inom området sker mycket snabbt krävs en person som har förmåga att testa, utvärdera och anpassa analyser.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av att arbete på UPPMAX/Bianca är önskvärt. Sökande behöver ha god arbetsdisciplin och noggrannhet. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, 9 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av:
Lars Feuk, lars.feuk@igp.uu.se, 018-471 4827

Välkommen med din ansökan senast den 7 mars 2023, UFV-PA 2023/598.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Ersättning
Individuell lönesättning

Så ansöker du
Sista dag att ansöka är 2023-03-07
Klicka på denna länk för att göra din ansökan

Arbetsgivarens referens
Arbetsgivarens referens för detta jobb är "UFV-PA 2023/598".

Omfattning
Detta är ett heltidsjobb.

Arbetsgivare
Uppsala Universitet (org.nr 202100-2932)

Arbetsplats
Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi

Kontakt
Camilla Nilsson
018-4710000

Jobbnummer
7458920

Observera att sista ansökningsdag har passerat.

Prenumerera på jobb från Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi

Fyll i din e-postadress för att få e-postnotifiering när det dyker upp fler lediga jobb hos Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi: